Perfeito, muito obrigado pela resposta. Ajudou bastante meu caro amigo

agora...pensando por outro lado, em teoria vc consegue montar:

/var/www/site.com.br/public/

as pasta internas do framework coloque em /var/www/site.com.br/ (que é acima da raiz do site)

e em /var/www/site.com.br/public/crm <arquivos publicos do seu framework, normalmente o index.php e assets js e css>

ai é o caso de ajuster no index.php do seu framework para ao invés de carregar dependencias um nivel pra cima, subir 2 níveis.

talvez funcione, embora ainda manteria separado em outro subdomínio e simplesmente redirecionaria site.com.br/crm para crm.site.com.br

O problema é que o sistema possuí 2 index, uma é do wordpress e a outra é dos arquivos criados para serem integrado. O sistema em wordpress é uma landing page, e o sistema criado para integração é um crm, acredito que no caso do subdominio igual você informou já resolveria, não?
esse crm está desenvolvido em que? colocando em uma subpasta deveria funcionar.
Esta desenvolvido em php. Vou efetuar testes para verificar se vai funcionar