Qual o tipo de filesystem você está instalando? brfs, ext4? O que você pode fazer é colocar uma instrução no grub para que sempre que o SO iniciar ele executar um checkdisk rápido para verificar se houve algum problema com o disco e ele se virar sozinho. Caso queira colocar, geralmente é no arquivo /etc/default/grub você adiciona a linha fsck.mode=force fsck.repair=yes Mas é bom dar uma pesquisada sobre, até porque não tenho informações sobre seu SO, partições e também é preciso ver se não existem badblocks nesse disco.

O fylesystem é ext4. 0 badblocks encontrados. Outra coisa é que o SO instalado é uma imagem clone de outra máquina.

Como você está fazendo o clone? Está usando algum software ou a própria gaveta está clonando? Tenta gerar uma ISO do SO, tem bons softwares que eu uso, como Systemback, Refracta ou PenguinEggs. Gera uma ISO e manda instalar nesse HD.
Eu estava fazendo a imagem pelo clonezilla. Fiz exatamente isso, baixei o ISO do SO e instalei na máquina e coloquei um timer de energia para simular quedas de energia, afim de fazer testes se a máquina vai continuar dando erro.