Existe 2 formas mais comuns de ganhar dinheiro com software:

• Licença de uso, onde o usuário compra uma vez e o produto é dela, como o Windows por exemplo;
• Mensalidade, o usuário paga mensalmente pelo uso do software, a maioria dos SaaS são assim.

De qualquer forma, seu software é um produto e se alguém compra um produto é necessário a emissão de nota fiscal.

Existem meios de emitir notas fiscais como pessoa física, mas se não me engano o imposto agregado será algo entre 27% e 30%, o que pode encarecer demais o valor final do produto.

A melhor forma de vender produtos (mesmo que seja software) é abrindo uma empresa, e isso não é tão simples como deveria ser, sugiro entrar em contato com algum contador para explicar todas as nuances desse processo.