Cara, acredito que não tenha nenhum outro caminho que não seja conversando com as pessoas e entendendo como as coisas funcionam, anotando, documentando, questionando...

Cada empresa tem seu jeito de trabalhar, o que inviabiliza a existência de um curso sobre "regras de negócio".

Mas isso não é uma coisa que você tenha que fazer apenas porque é programador nesse local, até mesmo se fosse trabalhar na recepção teria que aprender as regras de negócio que compreendem aquela atividade naquela empresa. Em todos os departamentos as pessoas precisam aprender as regras para fazer o trabalho delas, com você não vai ser diferente.