Algumas coisas não ficaram claras para tentar resolver o problema. As seguintes:
Quando a maquina "cai", qual o estado da maquina é mostrado pela aws running ou stopped?
Segundo, qual o tipo da instância(com relação a compra): Instâncias sob demanda ou Instâncias spot?
Instâncias spot podem ser interrompidas pela aws, é normal.
sobre os tipos de instância que citei: Opções de compra de instância
Opa, atualmente estou no modelo Instâncias sob demanda. Lá no painel, quando cai ainda mostra o status é running .
Neste caso, tenho a hipótese que o problema seja o que `gabrielvictorf` comentou. Você pode analisar esta hipótese verificando a aba "Monitoring" no painel da aws ao selecionar a instância desejada.
De qualquer forma, como o status contínua `running`, é uma evidência que o problema não é causado pela aws, e sim pela aplicação de alguma forma.