Normalmente eu uso tema dark, somente em ambientes escuros e de noite. Durante o dia como fico em ambiente claro uso tema light até na IDE. Me chamam de louco mas se não faço isso, a tela do notebook vira um espelho praticamente.
Sobre essa sua questão, isso ocorre em todas as telas? Ou é apenas em algumas ? Por um acaso tu usa oculos? Pode ser problema de visão chegando também.
Tambem faço isso, deixo meus dispositivos no modo adaptativo, modo claro de dia e modo escuro após o por do sol, alem de usar o filtro de luz azul de noite, só isso já melhorou muito o conforto aos olhos após passar o dia todo na frente de telas e melhorou o sono também.
Rapaz isso geralmente e em monitor em que tenha algum tema dark. Parece que a vista fica meio que queimada, quando a gente olha para uma fonte de luz por um tempo.