Confesso que não entendi muito bem a sua necessidade, mas pelo pouco que acho que entendi, para cada usuário você quer criar um outro registro no banco de dados?
Fala @lesnok
Na verdade o que eu faço com o usuário não é relevante, o ponto é:
Em um momento eu preciso retirar um Array Ordenado do banco de dados, e é um Array que representa usuários.
O que vou fazer com o Array é: após recebe-lo, vou selecionar um certo usuário que deve estar presente nesse Array, vou remove-lo da posição que ele estiver, e coloca-lo na último posição do Array, após isso salvar o Array no banco novamente.
Minha dúvida é algo na linha do que o juliodev disse, salvo uma lista de ids em texto ("1,2,3,4,..."), que aí assim não tem como relacionar tabelas.
Ou faço uma tabela intermediária de NxN?