Geralmente JMeter e Karate são utilizados para E2E testing.

Eu suponho que seu problema está sendo identificar se a mensagem é publicada no SNS para ser consumida pelo SQS. Se for o caso, na sua plataforma de testes, você pode colocar um subscriber adicional no mesmo tópico que o SQS está inscrito e verificar se a mensagem foi enviada via HTTP API do SNS.