Executei uma série de benchmarks na minha máquina com as seguintes especificações:

• WSL 2 Ubuntu 22.04.2 LTS
• AMD Ryzen 7 5700x 4.6Ghz, 8 núcleos
• RAM 16gb 3200Mhz CL18

Utilizei uma suíte de testes fornecida pelo @kht, que incluiu os seguintes casos de teste:

var Benchmark = require('benchmark');
var suite = new Benchmark.Suite;

suite
.add('desestruturação', function () {
    const n = 1000;
    let a = 0, b = 1;
    for (let i = 0; i < n; i++) {
      [a, b] = [b, a + b];
    }
})
.add('sem desestruturação', function () {
    const n = 1000;
    let a = 0, b = 1;
    for (let i = 0; i < n; i++) {
        let tmp = a;
        a = b;
        b += tmp;
    }
})
.add('desestruturação BigInt', function () {
    const n = 1000000n;
    let a = 0n, b = 1n;
    for (let i = 0n; i < n; i++) {
      [a, b] = [b, a + b];
    }
})
.add('sem desestruturação BigInt', function () {
    const n = 1000000n;
    let a = 0n, b = 1n;
    for (let i = 0n; i < n; i++) {
        let tmp = a;
        a = b;
        b += tmp;
    }
})
.on('complete', function () {
    console.log('Fastest is ' + this.filter('fastest').map('name'));
})
.on('cycle', function (event) {
    console.log(String(event.target));
})
.run({
    'async': true
});

Os resultados obtidos foram os seguintes:

Teste	Node	Bun
desestruturação	1.350.540	884.238
sem desestruturação	1.392.095	1.662.632
desestruturação BigInt	0.16	0.10
sem desestruturação BigInt	0.16	0.10